Forum MOOC Bioinfo - Forum du MOOC Bioinformatique 4

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Session 2021-2022.html Discussion générale 2

Détermination de la phase et codon start AUG 5

Analogies entre molécules du vivant et mots d’un langage ? Semaine 2 : Gènes et protéines 2

Le code génétique, une table à 3 entrées 3

Attestation 12 mai 2021 Discussion générale 4

Obtention d’attestation Discussion générale 7

Attestation, pourcentage erroné Discussion générale 2

Devons nous télécharger le notebook iPython 2

ON ne peut pas importer de modules Python dans Binder 2

Incohérence notes FAQ 2

Téléchargement en avance, est-ce possible ? Discussion générale 7

Télécharger l’ensemble des notebooks Python 2

Faisons connaissance ! Discussion générale 77

Robert hook 5

Origine des Celules 2

Adn et biologie de synthèse 1

Définitinon ORF 12

Support de l’information génétique dans le cosmos 1

Nombre d’opérations 5

Explication de l’asymetrie par le mécanisme de réplication 7

Les questions des quizz 4

Pre-requis et ressources 1

Paires de nucléotides ou code binaire ? 5

Un peu d’aide pour comprendre ? 4

Déclaration de variables et fonctions 2

Comment avoir le graphe dans python? 1

Problème d’execution 4

Importation de modules personnels Python 3

Calcul de la valeur de %GC et %AT 22

Réponses quizz 3.6.1 4

Obtention d’attestation du 3 mars 2021 Discussion générale 3

Erreur sur le score final Discussion générale 3

Promenade sur l’ADN 1

Erreur dans le slide 3? 4

Dessiner le chemin 1

Enrégistrement et clarté de la vidéo 2

Choix du coup minimal 4

Réponse quiz 4.8.1 4

Décompactage 5

Distance de needleman_wunsch 2

Exercice 4 semaines 1 4

Analyse Metagenomique 4

Transition , transversion 5

Substitution A-T G-C ou autre? 1

Rechercher les gènes avec le code génétique 4

La mise en forme de la seconde réponse au QCM est-t-elle critique? 5

Bravo Et aprés? Discussion générale 4

Erreur slide index calcul 2

Voici une solution qui utilise un dictionaire au lieu de quatre variables 1

Formule du nombre de comparaisons 1

Quizz semaine 2 3

Fonctionnement des Quizz FAQ 5

Exercise 6: regular expressions en Python 1

## question 3.3.1 5

Fin de cours 1

Complément python 2

Questionnaires Début & Fin? Discussion générale 3

Quiz question 1.10.2 / débogage de pseudo-code 1

Bug mineur dans Notebooks Jupyter v3.0: confusion de langues 1

Question pour les organisateurs Discussion générale 3

Index Discussion générale 4

Exercice 3 6

Exercice 1-1.html semanine 5 3

Pourquoi des fenêtres recouvrantes ? 2

Exercice 2-6.html Git Hub pages 4

Doublets 6

Retrouver les segments? 6

Importation de fonctions next_codon/break 5

Erreur d’installation fetch 1

Erreur non trouvée dans l’exercice 4

Prediction des gène Discussion générale 2

Livres sur la parcimonie et la vraisemblance 3

Imposible vérifier 4

Attestation Discussion générale 8

Quelle est l’exacte utilité de l’ORF? 7

Quiz 22 question 3.2.3 5

Question d’ordre général 2

Initialisation 3

Note attestation dans le tableau de bord 9

Ma conclusion face à votre conclusion 5

Exercice ¼ semaine 1 9

Calcul index 4

Algorithme naïf de recherche de motif 5

Echec de chargement clé ENA notebook section 1.10 Semaine 1 : ADN et séquences génomiques 4

Pourquoi une majorité de A et C (ou de G et T) sur un brin ? 5

Une protéine = 20 AA 3

Attention aux généralisations Semaine 3 : Prédiction des gènes 2

Archées 5

Langage Python Semaine 1 : ADN et séquences génomiques 2

Question 4.2.2 du quiz, réponses restrictives ? 2

Le “Texte” du génome 3

Champignon 2

Calcul % AT, GC 2

Question Discussion générale 2

Score globale et progression synchronisés? FAQ 3

Score de 60% pour obtenir l’attestation FAQ 8

Connaissance Discussion générale 3

Exemple Boyer-Moor 3ème comparaison 1

Je pense qu’il y a un petit bug qui traîne :slight_smile: 4

Exercice recherche codon stop Python 1

Depuis plusieurs jours grosse difficulté d’accés aux cours Discussion générale 2

Coûts? 1

Le zoomable_walk du notebook ne s’affiche pas bien 5

Sens de la promenade sur l’ADN ? 1

Éxercie 4-4.html semaine 1 3

Demande d’attestation Discussion générale 10

Codon stop / caractère de fin 3

Terme scientifique 4

Comptage de paires de nucléotides 2

À quoi sert 2

Écrire des tests imbriqués et liste de cas 3

Comment sait-on certaines informations données dans le cours 2

Code génétique et chromosomes 7

Module samples inconnu 2

Matrices de transition / Chaînes de Markov 3

Longueur génome 2

Pourquoi vouloir prédire l’origine de la réplication ? 5

Algorithme de Needleman 2

Utiliser la puissance de python 2

Utilisation des notebooks 7

Compréhension quiz 2.4 2

Question 2.6.1 Discussion générale 2

Énoncé exercice 5 4

Boyer-Moore-Horspool ou Boyer-Moore- 1

Écrire le nombre de gènes trouvés sur chaque phase pour les 6 phases 5

Nombre d’heures sur attestation? Discussion générale 4

Nucléotides pris en compte 4

Asymétrie et recombinaison génétique 2

Code_python_avec_index 1

Demande Discussion générale 4

Note finale attestation Discussion générale 5

Question concernant l’attestation de suivis avec succés Discussion générale 2

Parenthésage dernière diapo ? 3

Merci pour ce cours Discussion générale 5

Qu’est ce qu’un algorithme 3

Code génétique 3

C’est genial 1

Chevauchement de gènes dans la prédiction 2

PDF de la séquence 2 2

Ma note de progression dans le tableau de bord est restée bloquée Discussion générale 5

Algorithme douteux 6

Exercice ¼ en Python 97

Utiliser un tableau array 1

Comment utiliser iPython sur mon ordinateur. un lien pour le télécharger le python. Merci 2

Contenu en A-T C-G des séquences d’ADN Discussion générale 3

Reconnaissance d’un “nucléotide” 3

Instruction pass 5

Triplets dans la région non codante de l’ORF 4

Probabilité dépendante de la phase 2

Promenade sur l’adn + fetch 30

‘erreur pendant le chargement du notebook’ ‘forbidden’ 6

Performance Python 1

Pgm python de recherche codon stop et start 4

Erreurs des séquenceurs 1

Question 1.8.1 1

Question 1.7.1 Semaine 1 : ADN et séquences génomiques 1

Erreur de calcul dans la vidéo 5

Attestation de suivi Discussion générale 2

Notebook n’importe pas mpld3 2

La marche et le ratio de l’information 2

Sens du recouvrement des fenêtres 3

Représentation des données 1

Fonctions des introns Discussion générale 3

Demande d’explication sur les compromis de la conception d’algorithme Discussion générale 5

Prédiction avec Chaines de Markov 2

Implementation du code genetique 2

Question Vocabulaire 2

De la précision du vocabulaire 3

Demande d’éclaircissement concernant la réponse de la ligne bleue du quizz 2

Remerciements Discussion générale 1

Brin complémentaire 3

Exercice 2 6

Ppython 8

Pas de codage case en python ! 2

Question 1.5.3: “pseudo-code” 3

Merci Semaine 4 : Comparaison de séquences 1

Calcul de comparaisons 2

Brin représenté dans les algorithmes Discussion générale 2

Exercice no 6 4

Nombre de nucléotides 5

Algorithme Python 5

Algorithme d’alignement : question générale Semaine 2 : Gènes et protéines 3

Problème pour valider le quiz 12

Attestations de réussite du 13 Novembre Discussion générale 6

Algorithme de traduction 7

Algorithme+structure de données=program 2

Obtention attestation Discussion générale 5

Liaison hydrogène 2

Mosaïque lors de la transcription ? 3

Exercice semaine 1 : chaîne vide 2

Slide 12 : Division par 0 2

Diapo 6 Stop 4

Changer l’échelle du chemin Discussion générale 2

Question sur le quiz 29 5

Commentaires sur le Quiz Question 1.10.2 3

Question 2.7.2 du Quiz 2

Fin du cours - remerciements Discussion générale 1

Erreur/doute sur la def du nucléole? 2

Exercice 4-4.html : noms des variables 4

Accepter les cookies sur le site nbhosting.inria.fr 10

Proteïne opérationnelle 4

Erreur sur la première version du pseudo code Discussion générale 3

Utilisation de `next` comme variable 3

Probleme Python 2

Question 4.9.1 du quizz 39 10

Ma version du ¼ 2

:desert_island: Vacances en août Discussion générale 2

Erreur dans le pseudo-code 2

Problème pour récupérer les séquences génomiques 3

Comment traduire le pseudo-code en python ? 5

Icone Kernel error 2

Demande de clarification 2

Publications scientifiques 2

Transcription de la vidéo d’Alain Viari 5

Problème d’ouverture de notebook avec Opera Discussion générale 3

Fin de session au 14 Juillet Discussion générale 6

Extension de l’algorithmique Discussion générale 2

Question 1.2.2 4

Présence de RBS dans une région codante 6

Arn ou adn et ribosome 2

Introns et exons Discussion générale 2

iPython 5

Objet mathématique d’une autre nature 2

Exercice ¾ Tracé sur feuille 2

Extraction du génome Discussion générale 1

Erreur ou piège ? 1

Exercice 5 10

Absence du corrigé de l’exercice 4-6.html 11

Quel est l’intérêt des protéines ? 3

Cout construction arbre/index 3

Escherichia coli 5

Subtilis 17

Un peu difficile quand on debute en biologie 2

Def (dna) 5

Calcul du nombre de gènes sur autre bacille 4

Fin du cours et remerciement Discussion générale 1

Utilisation booknotes 5

Max (I, K) 3

Petite remarque 2

Créer son premier sujet FAQ 1

À propos de la question 1.5.2 langages de programmation 3

Comment « faire rentrer » des suites de plusieurs millions, voire milliards, de segments sur un seul et même écran ? 1

Erreur dans le pseudo code 2

Fonction minimal_couple(distances, species) 3

Distance minimale nécessaire 4

Dessiner 69

Comptage des nucloetides Discussion générale 5

Python Discussion générale 3

Code généttique 3

Exercice 3.6.1 , logique? 6

Comment entrer les indices? 3

Format imprimable des guides d’utilsiation FAQ 4

Je ne comprend pas la façon de s’évaluer 3

Absence François Rechenmann du 27 au 31-05.html Discussion générale 2

Ressources de test biologiques 5

Exercice de fin de semaine 3

Source python pour recherche codons stop et start 4

Pourquoi ne pas utiliser la méthode s.replace(old, new )? 4

À propos de l’algorithme avec fenêtre 5

Première séquence? 4

2.8 import de la fonction translate_dna_to_rna 3

Vidéo 4.5 Règles du jeu dans la Grille d’alignement 7

Bonnes pratiques pour partager du code dans le forum FAQ 2

Programme Python 2

Taduction AUG d’initiation 2

Convention ? pour le déplacement 2

Questionnaire de début de cours FAQ 3

Erreur dans le case de l’algo 2

Codes Python de traduction 1

Bienvenue dans le forum ! Discussion générale 3

Longueur du génome de Borrelia burgdorferi 3

lookupGeneticCode, fonction? 3

Comment récupérer la librairie Matplotlib 6

Runtime dans le complément 3

Problème algorithme python 3

Faisons connaissance Discussion générale 1

Questions sur l’origine de réplication 2

Sequence complementaire 2

Acheter un séquençage complet Discussion générale 4

Charte d’utilisation FAQ 2

Astuces pour les nouveaux utilisateurs FAQ 1

Politique de Confidentialité FAQ 3

Conditions générales d’utilisation Discussion générale 3