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Problème pour récupérer les séquences génomiques

dfialaire

Je travaille le MOOC sur une tablette Android et je réalise en même temps les algorithmes avec une application Python Android, il est difficile de récupérer la séquence génomique même en passant par le lien FASTA on ne peut pas copier coller autant de texte et l’application fetch en dehors du netbook ne semble pas fonctionner.

j’espère que nous verrons au cours de ce MOOC une autre manière de sélectionner des séquences

skypat13

Bonjour,
j’ai installé python jupyter sur mon ordinateur, j’aimerai savoir, si et comment faire, pour importer des séquences génomique réelles comme dans l’exemple 1.7 “from samples import borrelia” ?
Merci

ThierryParmentelat

bonjour

tous les notebooks et le code du cours sont dans le repo git

notamment les imports sont
modules/samples.py
modules/fetch.py
et certains fragments sont dans data/