Bonjour,
J’aimerai avoir un séquençage complet d’un de mes axolotls.
Combien cela me coûterait ? quelle est la procédure ? Quels laboratoires ? Quelle serait la taille approximative du fichier résultant ? Quel serait sa structure ? Texte ? spécifique au séquenceur ? open source ? propriétaire ?..
Cordialement.
Il n’est malheureusement pas possible de répondre précisément à vos questions dans le cadre ce MOOC.
Je vous invite donc à soumettre votre projet et vos attentes à une des nombreuses entreprises spécialisées dans le séquençage.
Bonsoir.
Merci tout de même pour cette réponse.
Il est vrai que ma requête est peut être disproportionnée par rapport au démarrage de ce cours.
Donc pour revenir vers une dimension plus pédagogique de ce MOOC, ou pourrais-je me procurer un fichier de taille raisonnable au format texte d’une séquence de nucléotides (finissant par un #) me permettant « d’alimenter » les algo présentés que je souhaite implementer ?
Cordialement.
Vous pouvez trouver des séquences “réelles” dans les bases de données GenBank ou EMBL.
Notez que le caractère de fin de séquence est utilisé dans le pseudocode du cours. Si vous écrivez des programmes dans un langage de programmation, typiquement Python, vous serez amené à utiliser (et profiter) les facilités du langage choisi quant au traitement des chaînes de caractères.