Vidéo 4.5 Règles du jeu dans la Grille d’alignement

Bonjour,
N’y aurait-il pas une inversion des consignes dans la diapo 3 ?
Il me semble que le trait vertical correspond à une insertion dans la séquence 2 et non dans la séquence 1 comme indiqué.

Bonjour GrandHand,

La séquence n°1 est donnée verticalement, alors que la séquence n°2 est donnée horizontalement.
Donc une barre verticale correspond à une insertion dans la séquence n°1, non ?

Si la séq 1 est donnée verticalement, c’est bien une barre horizontale qui symbolise une insertion dans cette séq, autrement dit une interruption dans l’avancée de son code.
Cela est corroboré par les exemples de la diapo 4 et par le résultat du quizz que j’ai validé.

“Insertion” signifie qu’un nucléotide est supposé être venu s’insérer dans la séquence. “délétion” signifie qu’un nucléotide est supposé avoir disparu.

Pour être plus claire, je retranscris l’exemple bleu de la diapo 4 :

Séq 1 : A G — A T G C —
2 insertions correspondant aux 2 barres horizontales de la grille

Séq 2 : A G T A T — C T
1 insertion correspondant à 1 barre verticale de la grille

Et donc, contradiction avec les affirmations de la diapo 3…

Je me demande si le souci ne provient pas d’une mauvaise interprétation du tiret ou du mot insertion.
Le tiret apparaît pour indiquer qu’il y a un décalage avec l’autre séquence, qui elle a fait l’objet de l’insertion.
Si les barres apparaissent dans la séquence 1, c’est que les insertions correspondantes se sont faites dans la séquence 2.
A G — A T G C —
A G T A T — C T

Merci pour ces précisions qui m’ont permis de comprendre.
Le problème vient effectivement du vocabulaire.

Dans cette vidéo, insertion a 2 significations :

• diapo 3 : insertion d’un nucléotide dans une séquence
• diapo 4 : insertion d’un tiret virtuel dans l’autre séquence pour obtenir l’alignement