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Explication de l’asymetrie par le mécanisme de réplication

ket314

Bonjour,

Je ne comprends pas très bien la fin de la vidéo, l’algorithme DNA walk (avec changement d’échelle) sert juste à représenter la séquence d’ADN, puis pour la séquence d’ADN de Borrelia Burgdorferi on observe une asymétrie du tracé.

Vous expliquez cette observation par le mécanisme de réplication de l’ADN (grâce à la molécule d’ADN polymérase).

Mais je ne comprends pas quel est le rapport entre l’asymétrie et le mécanisme de réplication puisque l’algorithme DNA walk ne fait qu’observer une séquence d’ADN déjà répliqué ou pas encore répliqué et vous expliquez donc que c’est du à un mécanisme de réplication donc qui s’effectue lorsque l’ADN passe à l’étape de réplication.

L’algorithme dna walk n’observe qu’une séquence et non pas un phénomène qui est en cours.

J’espère avoir été compréhensible ^^.

FRechenmann

L’algorithme du DNA walk considère effectivement la séquence génomique d’une bactérie.

La répétition, génération après génération, de la duplication de la molécule d’ADN double brin induit des biais de composition en G-C qui sont mis en évidence par l’algorithme.

ket314

Bonjour,
merci de votre réponse.

skypat13

Bonjour,

je ne comprends pas pourquoi il y a un biais de composition puisque la réplication donne 2 molécules d’ADN identiques.

Je n’ai pas compris comment on peut prédire l’origine de réplication sur le “dessin” ?

Merci de m’éclairer

FRechenmann

Bonjour,

La réplication produit 2 molécules d’ADN identiques, aux mutations près.

Ce sont les biais de composition qui permettent de détecter l’origine de réplication.

Ces biais seraient la conséquence cumulative des modifications induites par le mécanisme asymétrique de réplication.

skypat13

on parle de cette asymétrie de composition dans liens suivant :

Mutations spontanées C → U par désamination des cytosines.
Enrichissement concomitant en Thymine après réparation.

http://flemingite.free.fr/Supc2/La_conservation_de_linformation_genetique_au_cours_de_sa_replication.html

jortega25

Bonjour.
Merci pour ce document, on y trouve des réponses à partir de la page 26 notamment.