INSTALLATION DES LOGICIELS R ET RSTUDIO
Avant de commencer, il sera nécessaire d'installer les deux logiciels suivants : R et RStudio. L'installation de ces logiciels ne pose normalement pas de problème, quel que soit le système d'exploitation utilisé (Windows, Mac, Linux), et cette procédure est largement documentée sur les sites respectifs d'hébergement de ces logiciels :
- Le logiciel R peut être téléchargé sur le site CRAN : http://cran.r-project.org
- Le logiciel RStudio peut être téléchargé sur le site : http://www.rstudio.com
INTRODUCTION à R
Les documents suivants constituent une introduction au langage R. En particulier, "Les bases du langage R" et "La gestion des données avec R" introduisent les notions fondamentales pour la manipulation des données avec R. Si vous rencontrez des problèmes pour importer les fichiers de données ou recoder les variables avec R, il est recommandé de lire "La gestion des données avec R". Les documents "Le langage R Markdown" et "L'interface RCommander" fournissent des compléments pour mieux comprendre la génération automatique de rapports automatisés et l'utilisation d'interface graphique pour accéder aux principales fonctionnalités de R pour l'analyse statistique des données.
Documents à consulter (HTML) :
- Les bases du langage R (ainsi que le script R rassemblant toutes les commandes utilisées dans le document), ou la version PDF pour impression
- La gestion des données avec R, ou la version PDF pour impression
- Le langage R Markdown, ou la version PDF pour impression
- L'interface RCommander, ou la version PDF pour impression
BASES DE DONNEES
Etude sur la sante mentale en prison
Données version court : smp1.csv
Données version longue : smp2.csv
Présentation des données : télécharger
Etude sur la satisfaction des patients séjournant à l'hôpital
Données : satisfaction_hopital.csv
Présentation des données : télécharger
Autres
Données temporelles : hdrs.csv
Données de survie : alcool.csv
RESSOURCES D'ACCOMPAGNEMENT POUR LES LABS
Présentation des Labs
Document à consulter (HTML) : Introduction au langage R et à RStudio, ou la version PDF pour impression
Ce document, qui inclut des commandes et notions qui ne sont pas nécessairement présentées durant les présentations, est un complément aux vidéos "Labs". Il est recommandé de lire avant ou après chaque Lab la section correspondante dans ce document.
Scripts R pour chaque session
L'ensemble des commandes R utilisées dans le document Introduction au langage R et à RStudio sont disponibles, ci-dessous, sous forme de scripts R :
Remarque : Il n'y a pas de fichier R pour le Lab 3, mais le fichier RMarkdown et son rendu HTML peuvent être téléchargés : rapport.Rmd et rapport.html.