Archive du forum du MOOC Recherche Reproductible Session 2

DocFetcher + Metadata Sidecar Files

GuillaumeCharbonnier

Bonjour,

J’ai testé avec grand intérêt Exiftools et je m’interroge sur l’application de “Metadata Sidecar Files” -
https://sno.phy.queensu.ca/~phil/exiftool/metafiles.html -
à l’ensemble des fichiers générés par un workflow d’analyses.
Avez-vous déjà testé DocFetcher pour cette application où on ne souhaite pas retrouver le “metadata sidecar file” mais le fichier auquel il est associé ?
Idéalement, j’aimerais pouvoir faire un glissé-déposé d’un groupe de résultats de DocFetcher directement dans d’autres applications comme on peut le faire quand ces fichiers se trouvent dans un explorateur de fichiers. Cela n’a pas l’air d’être implémenté dans DocFetcher. Voyez-vous une alternative pour ce type d’utilisation ?
J’ai lu cette suggestion mais cela s’applique mal à mon cas d’utilisation:
Stockage des métadonnées dans les noms de fichier

En vous remerciant pour vos idées

Guillaume

ChristophePouzat

Bonjour Guillaume,

Je n’ai encore jamais « joué » avec les sorties sidecar de Docfetcher. À première vue, j’aurais tendance à les éviter car je préfère n’avoir qu’un seul fichier, mais il n’y a pas de règle absolue donc si cela vous permet de faire plus de chose avec Docfetcher, n’hésitez pas. Cela signifie aussi que je n’ai pas de réponse concrète à donner à votre première question.

Pour la seconde question, je n’ai qu’une piste à vous indiquer : Docfetcher est accessible depuis Python et c’est vers cette possibilité que je m’orienterais pour essayer de faire l’équivalent des glisser-déposer que vous souhaitez effectuer. Je n’ai encore jamais utilisé l’API Python de Docfetcher, je vais le faire dans les jours qui viennent ; je vous tiendrai au courant.

Christophe

GuillaumeCharbonnier

Bonjour Christophe,

Je vous remercie pour ces informations. J’ai ajouté l’exploration de l’API Python de Docfetcher à ma TODO list. J’étudie également cette solution qui semble faire correctement ce dont j’ai besoin :

Je ne pense pas pouvoir me passer de sidecar parce que je souhaite ajouter des étiquettes à des types de fichiers qui ne sont pas prévus pour en stocker.

Bien cordialement

Guillaume

ChristophePouzat

Bonjour Guillaume,

Effectivement, si vous avez des fichiers qui n’ont aucune place pour des métadonnées, vous aurez du mal à vous passer d’un sidecar.

J’ai installé TagSpaces, je vais voir ce que ça donne, merci pour l’info !

Pour les fichiers et les métadonnées et si vous êtes utilisateur d’emacs, les fonctionnalités de capture de orgmode pourraient vous fournir une solution. Je ne les utilise pas, mais je crois que Konrad le fait assez systématiquement.
À suivre.

Christophe

khinsen

Je m’en sers en effet pour prendre des notes, mais pas pour gérer des métadonnées autre que les étiquettes dans mes notes.